Από γενετικά δεδομένα σε δομικά μοντέλα και αντίστροφα: Σχέσεις δομής-λειτουργίας του μεταφορέα πουρινών UapA

A- Ao A+ GR

Please use any of these identifiers to cite or link to this item:
http://hdl.handle.net/10795/3199
http://repository.edulll.gr/3199

PDF (866.95 kB)

Abstract	Στην παρούσα εργασία, στηριζόμενοι στην πρόσφατα δημοσιευμένη κρυσταλλογραφική δομή του βακτηριακού μεταφορέα ουρακίλης UraA και μέλους της οικογένειας ΝΑΤ/NCS2 7, χρησιμοποιήσαμε αλγορίθμους πρόβλεψης διαμόρφωσης πρωτεϊνών προκειμένου να κατασκευάσουμε την τρισδιάστατη δομή του UapA. Βασιζόμενοι στο μοντέλο αυτό πραγματοποιήσαμε υπολογισμούς πρόσδεσης μοριακής μηχανικής με υπόστρωμα την ξανθίνη (docking calculations). Τέλος, μελετήθηκε ο μηχανισμός πρόσδεσης άλλων υποστρωμάτων και οι θεωρητικοί υπολογισμοί επιβεβαιώνουν τα πειραματικά μας αποτελέσματα.
Author/Creator	Κωστή, Β.; Λαμπρινίδης, Γ.; Μυριανθόπουλος, Β.; Διαλλινάς, Γ.; Μικρός, Ε.
Contractor	Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών (ΕΚΠΑ)
Language	Greek
Date	2011
Extent	1 pages
Subject	βιολογία φαρμακευτική υγεία
Keywords	Μεταβολίτες, Μοντελοποίηση, Παθογόνοι μύκητες, Πρωτεΐνες, Ξανθίνη, Πουρίνες, Αλγόριθμοι πρόβλεψης, Μηχανισμός πρόσδεσης πρωτεΐνών
Is Related to	Dynamic elements at both cytoplasmically and extracellularly facing sides of the UapA transporter selectively control the accessibility of substrates to their translocation pathway Modelling, substrate docking and mutational analysis identify residues essential for the function and specificity of the purine-cytosine transporter FcyB. Identification of the substrate recognition and transport pathway in a eukaryotic member of the nucleobase-ascorbate transporter (NAT) family Modeling, substrate docking, and mutational analysis identify residues essential for the function and specificity of a eukaryotic purine-cytosine NCS1 transporter Mutational analysis and modeling reveal functionally critical residues in transmembrane segments 1 and 3 of the UapA transporter Μια συνδυαστική υπολογιστική και γενετική προσέγγιση για τη μελέτη των σχέσεων δομής-λειτουργίας στο μεταφορέα κυτοσίνης-πουρινών FcyB Γενετικές, μοριακές, βιοχημικές και βιοφυσικές προσεγγίζεις στη μελέτη των σχέσεων δομής – λειτουργίας διαμεμβρανικών μεταφορέων πουρινών
Type	Text (Conference or workshop item (Poster))
Scientific Coordinator	Διαλλινάς, Γεώργιος
Project Notes	Πράξη: Γενετικές, μοριακές, βιοχημικές και βιοφυσικές προσεγγίσεις σχέσεων δομής-λειτουργίας διαμεμβρανικών φορέων πουρινών